Popis heraldického symbolu: Vlajka Čkyně je červená. V dolní části, zhruba od druhé do čtvrté pětiny šířky, se zvedá zelený pahorek. Na něm stojí bílá věž s modrou valbovou střechou ozdobenou dvěma bílými makovicemi. Věž má zavřenou bránu a pod cimbuřím čtvercové černé okno. Na cimbuří po stranách stojí dva bílí rytíři v plné zbroji s přilbami. Každý z nich drží v zdvižené ruce kámen – rytíř blíže k žerdi v pravé a rytíř dále od žerdi v levé. Druhou ruku mají opřenou o meč zapíchnutý do cimbuří. Poměr stran vlajky je 2:3.
Udělení vlajky k datu: 12. 7. 2023
Rozhodnutí o vlajce, číslo: 61
Dominantní prvky vlajky: věž, rytíři
Důležíté barvy: červená, bílá, zelená
| Vlajka vesnice Braňany - Obě vlajky zobrazují kvádrovanou/hranatou věž s cimbuřím a s černými okny. Obě používají červenou, bílou, černou a zelenou barvu. |
| Vlajka vesnice Staré Město - Obě vlajky využívají červenou a zelenou barvu a dominantním motivem je bílá věž (v případě Čkyně s cimbuřím, u Starého Města s gotickou bránou). |
| Vlajka města Doksy - Dominantní barvou obou vlajek je červená a doplňkovou zelená a bílá. Na obou vlajkách je vyobrazena bílá věž s cimbuřím na zeleném návrší. |
 | Vlajka obce Lčovice další informace... |
 | Vlajka obce Bohumilice další informace... |
 | Vlajka obce Bošice další informace... |
 | Vlajka obce Malenice další informace... |
 | Vlajka obce Vacovice další informace... |
 | Vlajka obce Zálezly další informace... |
| Vesnice Čkyně má udělený také oficiální obecní znak. |
| Obec: | Čkyně |
| Okres: | Prachatice |
| Kraj: | Jihočeský |
| Typ obce: | vesnice |
| Počet obyvatel: | 1561 |
| Katastrální výměra: | 2068 ha |