Popis heraldického symbolu: Vlajka Čížkrajic je tvořena dvěma svislými pruhy. Jeden je žlutý a zelený, rozdělený diagonálně od levého horního rohu k pravému dolnímu rohu. Druhý pruh je šedivý. V žlutém a zeleném pruhu vyrůstají z dělící čáry dva lístky lípy, jeden žlutý a jeden zelený. Poměr šířky vlajky k její délce je 2:3.
Udělení vlajky k datu: 23. 6. 2022
Rozhodnutí o vlajce, číslo: 30
Dominantní prvky vlajky: lipové listy
Důležíté barvy: žlutá, zelená, šedá
| Vlajka vesnice Lipinka - Společným motivem je lipový list a společné barvy jsou žlutá a zelená. Na obou vlajkách se lipový list nachází na žlutozeleném pozadí, byť na vlajce Čížkrajic je toto pozadí rozděleno kosmo a na vlajce Lipinky svisle. |
| Vlajka vesnice Myslín - Vlajky Čížkrajic a Myslína obsahují lipové listy a shodují se v použití žluté a šedé (popeličné) barvy. |
| Vlajka vesnice Knyk - Dominantní barvou obou vlajek je zelená doplněná žlutou a šedou/stříbrnou. Motiv obou vlajek tvoří lipové listy, které jsou na vlajce vyobrazeny ve žluté a v případě Čížkrajic i v zelené barvě, oproti zelenému, respektive šedozelenému pozadí. |
 | Vlajka obce Kamenná další informace... |
 | Vlajka obce Trhové Sviny další informace... |
 | Vlajka obce Žár další informace... |
 | Vlajka obce Besednice další informace... |
| Vesnice Čížkrajice má udělený také oficiální obecní znak. |
| Obec: | Čížkrajice |
| Okres: | České Budějovice |
| Kraj: | Jihočeský |
| Typ obce: | vesnice |
| Počet obyvatel: | 270 |
| Katastrální výměra: | 900 ha |